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Home Biochimica

Ligasi

di Chimicamo
4 Agosto 2022
in Biochimica, Chimica
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ligasi-chimicamo

ligasi-chimicamo

La ligasi, dal latino lĭgāre, che significa legare, è una classe di enzimi che catalizzano la formazione di legami  C-C, C-S, C-O e C-N fra molecole differenti tramite di reazioni di condensazione. Generalmente una reazione catalizzata da questa classe di enzimi è rappresentata dalla generica reazione:

Sommario nascondi
1 Nomenclatura
2 Classificazione
3 EC 6.1
4 EC 6.2
5 EC 6.3
6 EC 6.4
7 EC 6.5
8 EC 6.6

Ab + C → A–C + b

Nomenclatura

I nomi comuni di questi enzimi includono spesso la parola “ligasi”, come la DNA ligasi, enzima comunemente usato nei laboratori di biologia molecolare per unire frammenti di DNA . Altri nomi comuni per le ligasi includono:

  • sintetasi usati per sintetizzare nuove molecole
  • carbossilasi usati per aggiungere anidride carbonica a una molecola.

Classificazione

Sono classificate con la sigla EC 6 e suddivise in sei sottoclassi a seconda del tipo di legame catalizzano la formazione

EC 6.1

Con questa sigla sono indicate le ligasi che catalizzano la formazione di un legame carbonio-ossigeno. Un esempio è la tirosina–tRNA ligasi che catalizza la seguente reazione:

ATP + L-tirosina + tRNATyr → AMP + difosfato + L-tirosil-tRNA

EC 6.2

A questa sottoclasse appartengono gli enzimi che catalizzano la formazione di un legame carbonio-zolfo. Un esempio è la Citrato—CoA ligasi che catalizza la seguente reazione:

ATP + citrato + CoA →  ADP + fosfato + (3S)-citril-CoA

EC 6.3

A questa sottoclasse appartengono gli enzimi che catalizzano la formazione di un legame carbonio-azoto. Un esempio è l’asparagina sintetasi o aspartato-ammoniaca ligasi che genera asparagina a partire dal aspartato secondo la reazione

ATP + L-aspartato + NH 3 → AMP + difosfato + L-asparagina

EC 6.4

A questa sottoclasse appartengono gli enzimi che catalizzano la formazione di un legame carbonio-carbonio. Un esempio è la piruvato carbossilasi che catalizza la reazione

  Il DDT

piruvato + HCO3–+ ATP → ossalacetato + ADP + P

EC 6.5

Sono usate per formare un legame fosfodiesterico. La più nota è la DNA ligasi che facilita l’unione dei filamenti di DNA catalizzando la formazione di un legame fosfodiesterico. Svolge un ruolo fondamentale durante il processo di duplicazione del DNA

EC 6.6

Servono per formare un legame tra azoto e un metallo. Un esempio è la magnesio-chelatasi che, infatti, catalizza l’inserimento di Mg2+ nella protoporfirina IX  intermedio nella via metabolica della biosintesi delle porfirine.

Tags: asparaginaporfirinereazioni di condensazionetRNA

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Il Progetto Chimicamo

Massimiliano Balzano, ideatore e creatore di questo sito; dottore di Scienza e Ingegneria dei Materiali presso l’Università Federico II di Napoli. Da sempre amante della chimica, è cultore della materia nonché autodidatta. Diplomato al Liceo Artistico Giorgio de Chirico di Torre Annunziata.


Maurizia Gagliano, ha collaborato alla realizzazione del sito. Laureata in Chimica ed iscritta all’Ordine professionale. Ha superato il concorso ordinario per esami e titoli per l’insegnamento di Chimica e Tecnologie Chimiche. Docente.

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