Emoproteine

Le emoproteine sono metalloenzimi che costituiscono un’ampia classe di molecole biologiche coinvolte in una varietà di importanti reazioni biochimiche, come la conservazione e il trasporto di ligandi biatomici, la segnalazione cellulare, la catalisi enzimatica e il trasporto di elettroni.

Le emoproteine sono proteine ​​contenenti una struttura porfirinica in cui è presente una struttura chimica complessa e sono costituite da quattro anelli di pirrolo legati tra loro tramite ponti metinici –CH=.  I quattro atomi di azoto presenti al centro della molecola possono legarsi a uno ione metallico abitualmente di carica +2 o +3 come il ferro nell’emoglobina, il cobalto nella vitamina B12 e il magnesio nella clorofilla per formare stabili complessi organometallici.

​​Nei mammiferi le emoproteine più abbondanti sono, l’emoglobina e la mioglobina che fungono da trasportatori di ossigeno mente tra le altre emoproteine vi sono vari citocromi ed enzimi, come ossigenasi, perossidasi, ossido nitrico (NO) sintasi che catalizza la produzione di monossido di azoto a partire da ossigeno e arginina, che viene trasformata in citrullina o guanilato ciclasi che catalizza la conversione del guanosintrifosfato (GTP) in guanosina monofosfato ciclico (cGMP) e pirofosfato.

Struttura delle emoproteine

Le emoproteine ​​costituiscono un gruppo molto rilevante di proteine ​​che presentano l’eme come gruppo protesico ovvero un cofattore di natura non proteica cioè non costituito da amminoacidi che si lega strettamente, spesso tramite legame covalente, a proteine ​​o enzimi che può essere di natura organica come vitamine, polisaccaridi o lipidi o di natura inorganica come ioni metallici.

Gli ioni metallici sono spessi di metalli di transizione come il ferro nel gruppo eme, lo zinco nell’anidrasi carbonica, il rame nel complesso IV della catena respiratoria e il molibdeno nella nitrato reduttasi. Il gruppo eme è un composto di coordinazione. Il gruppo eme presenta come centro di coordinazione uno ione ferrico Fe³⁺ o ferroso Fe²⁺ il quale è legato ad un legante macrociclico che, nel caso dell’eme, è una porfirina.

Tipi di emoproteine

In natura esistono diversi tipi di emoproteine che si differenziano sulla base del numero di catene polipeptidiche che possono essere presenti. Vi sono infatti emoproteine ​​con una sola catena polipeptidica, ​​che pertanto non hanno struttura proteica quaternaria come, ad esempio, il citocromo C. di contro vi sono emoproteine con un gran numero di subunità e una disposizione tridimensionale molto complessa e ben organizzata.

Un secondo parametro che differenza i vari tipi di emoproteine ​​è legata al livello di isolamento della tasca dell’eme. Nella maggior parte dei casi, infatti, è presente un isolamento idrofobico attorno che è costituito dalle catene laterali dei residui di amminoacidi che si incontrano in prossimità del sistema ferro porfirinico.

Ciò impedisce un grado significativo di penetrazione delle molecole d’acqua nella tasca dell’eme, che può provocare numerose reazioni chimiche che coinvolgono il centro metallico di questo gruppo protesico e, di conseguenza, la perdita della sua funzione biologica. Inoltre, l’isolamento dell’eme evita la dimerizzazione tra gruppi eme che causa la perdita di funzione delle diverse emoproteine.

La relazione tra struttura e funzione delle emoproteine ​​ha svariate implicazioni nei processi biochimici, come la sintesi biologica dell’eme, cambiamenti dei leganti, unfolding dei polipeptidi dovuto a cambiamenti di pH, denaturazione termica, meccanismi di autossidazione e altri processi.

Principali emoproteine

Emoglobina

L’emoglobina (HB) una metalloproteina contenente ferro che si lega all’ossigeno ossidandosi da Fe²⁺ a Fe³⁺ durante il passaggio del sangue nei polmoni e lo cede ai tessuti nella circolazione periferica riducendosi nuovamente a Fe²⁺.

Quando l’ossigeno molecolare si lega alla metalloproteina si forma l’ossiemoglobina che si forma a livello dei capillari polmonari durante la respirazione e si scinde al livello dei tessuti a cui cede ossigeno. trasporta O₂ dai polmoni ai tessuti dove perde O2 per ritornare ai polmoni.

L’emoglobina che ha assunto O₂ viene detta ossiemoglobina e quando non trasporta O2 viene detta deossiemoglobina. Questi due composti hanno colori diversi e ciò giustifica il fatto che il sangue arterioso contenente ossiemoglobina è di colore rosso vivo mentre il sangue venoso contenente deossiemoglobina è di colore rosso cupo.

L’ossigeno si lega all’ Hb  nei polmoni secondo la reazione
Hb + O₂ → HbO₂
con formazione di ossiemoglobina HbO₂.

Nei tessuti viene rilasciato l’ossigeno:
HbO₂ → Hb + O₂
e si riottiene la deossiemoglobina.

Poiché ogni molecola di Hb ha quattro subunità, ognuna con il suo gruppo eme si può combinare con quattro molecole di O₂ in quattro stadi. La reazione con O₂ avviene in 0.1 secondi e, una volta che una molecola di O₂ si è legata, cambia la forma dell’emoglobina rendendo più semplice il successivo legame con O₂.

Mioglobina

La mioglobina (Mg) è una proteina globulare contenente il gruppo eme che si trova nelle cellule dei miociti del cuore e del muscolo scheletrico. È un’emoproteina citoplasmatica costituita da una singola catena polipeptidica di 154 amminoacidi. La mioglobina svolge tre ruoli fondamentali ovvero quello di fornire ossigeno ai muscoli rilasciandolo ai mitocondri che compongono la catena respiratoria, fungere da tampone delle concentrazioni di ossigeno intracellulare e da riserva di ossigeno nei muscoli e diffondere ossigeno.

Essa inoltre ha funzioni enzimatiche, è necessaria per la decomposizione dell’ossido nitrico bioattivo in nitrato la cui rimozione migliora la respirazione mitocondriale. La mioglobina, inoltre, funziona per rimuovere le specie reattive dell’ossigeno (ROS) interagendo con gli acidi grassi, che possono essere metabolicamente importanti in condizioni ossigenate e con un elevato fabbisogno energetico.

Neuroglobina

La neuroglobina (Ngb) è un’emoproteina intracellulare globulare monomerica di circa 150 aminoacidi con una massa molecolare relativa di 17  kDa strutturalmente simile alla mioglobina e alle catene α e β dell’emoglobina. Questa emoproteina, che è associata alle proteine ​​mitocondriali, è espressa nel sistema nervoso ma è localizzata anche nel tratto gastrointestinale, nel tessuto endocrino e nella retina.

La neuroglobina e protegge le cellule cerebrali dallo stress ossidativo, dall’ipossia, dall’ischemia e dalla disfunzione mitocondriale e inibisce la segnalazione apoptotica mitocondriale-dipendente eliminare le specie reattive dell’ossigeno e specie reattive dell’azoto.

 Citoglobina

La citoglobina (CYGB) è la quarta delle emoproteine più importanti e l’ultima ad essere scoperta nel 2001 che, come l’emoglobina, la mioglobina e la neuroglobina, ha la caratteristica comune di una elevata affinità per l’ossigeno molecolare attraverso il ferro eme situato al centro dell’anello porfirinico.

Le emoglobine classiche (Hb e Mb) sono penta-coordinate nella forma desossi e presentano quattro siti coordinati con quattro atomi di N dell’anello porfirinico, il quinto sito è coordinato con il residuo di istidina e il sesto sito è vacante e ad esso si legano le molecole di O₂

Al contrario, la forma desossi  della citoglobina così come quella della neuroglobina è esacoordinata sia nella sua forma ferrosa che ferrica e, pertanto, non ha siti di coordinazione del ferro eme per i leganti gassosi. Ciò implica che indicando che un legante esterno all’eme necessita della dissociazione di uno interno e, nella fattispecie, dell’istidina. Tuttavia, nonostante la differenza nelle loro strutture di coordinazione, CYGB mostra un’elevata affinità per l’ossigeno molecolare paragonabile a quella della mioglobina in condizioni fisiologiche.

La struttura cristallina di CYGB suggerisce che questa proteina sia un omodimero legato alla cisteina, con ciascuna tasca dell’eme rivolta verso i lati opposti della superficie del dimero e potrebbe essere una proteina redox-sensibile, perché ha due residui di cisteina i cui gruppi SH possono essere liberi quando l’ambiente circostante è riduttivo o formare un ponte disolfuro in un ambiente ossidativo. Inoltre, ha ferro eme, che è Fe³⁺ in un ambiente ossidativo o Fe²⁺ in un ambiente riduttivo.

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